وهو يحمل إسم السيد أحمد البدوي المتوفى عام 1276م، مؤسس الطريقة البدويّة، نسبة إليه، ويرجع تاريخ بناء هذا المسجد إلى سنة 1343م وقد أزيل عند تخطيط محلة المرفأ التي كان يقع فيها، وكانت عليه نقيشة رقّّم عليها أن الذي بناه هو الأمير عز الدين بن أزدم إبن عبد الله الخوارزمي الناصري والي بيروت آنذاك، كما تشير إلى ذلك النقيشة التي كانت فوق بابه، وفيها الكتابة التالية:
بسم الله الرحمن الرحيم إنما يعمّر مساجد الله من آمن بالله واليوم الآخر وأقام الصلاة، أنشأ هذا المسجد المبارك الفقير إلى الله تعالى الأمير عز الدين بن أزدم بن عبد الله الخوارزمي الناصري في شهور، سنة ثلاثة وأربعين وسبعماية ابتغاء ثواب الله تعالى والفوز في الدارين والحمدُ لله رب العالمين وصلى الله على سيدنا محمد وآله وصحبه وسلّم.